Estonca, Baltık bölgesinde konuşulan bir dil olup, Arapça ile birçok yönden benzerlikler gösterir. Bu iki dil arasında ortak olan özelliklerden biri, dilin yapısında kullanılan köklerdir. Arapça ve Estonca dilinde kelime oluşumu, bir kelime kökünün üzerine ekler eklenerek yapılır. Bu ekler, kelimenin anlamını belirtir ve dilin yapısına göre değişir. Örneğin, Arapça dilinde "kalb" kökü "kalp" anlamına gelirken, Estonca dilinde "süda" olarak kullanılır. Arapça ve Estonca dilinde de gramer yapısı benzerdir. Her iki dil de cinsiyet, çoğul ve tekil gibi özellikleri belirten ekler kullanır. Arapça dilinde "kitab" kelimesi "kitap" anlamına gelirken, Estonca dilinde "raamat" olarak kullanılır. Benzer şekilde, Arapça dilinde "dar" kelimesi "ev" anlamına gelirken, Estonca dilinde "maja" olarak kullanılır. Estonca ve Arapça dilinde ayrıca benzer özellikleri olan bir diğer önemli konu da seslendirme ve yazım kurallarıdır. Her iki dil de seslendirme ve yazım kuralları çok katıdır ve bu kurallara uymak zorunludur. Örneğin, Arapça dilinde "ب" harfi sadece "b" sesi ile okunur ve yazılırken, Estonca dilinde "b" harfi aynı şekilde sadece "b" sesi ile okunur ve yazılır. Arapça ve Estonca dilinde konuşulan diller arasında çok az sayıda kelime benzerliği vardır. Bu kelime benzerlikleri genellikle İslami kökenli kelimelerdir ve bu kelimeler Arapça dilinden Estonca diline tercüme edilebilir. Örneğin, Arapça dilinde "islam" kelimesi "İslam" anlamına gelirken, Estonca dilinde "islam" olarak kullanılır.